Argumento: Siglo XXV. Un terrible virus ha arrasado con toda la humanidad, excepto con Bregna, una ciudad controlada por cámaras de seguridad y liderada por un grupo de científicos. Aeon Flux es una misteriosa asesina que trabajan para los Monicanos, un grupo de rebeldes que tratan de derrocar al gobierno. Cuando es enviada en una misión para matar al Presidente, un extraño e inquietante misterio se abre ante ella...